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东方天意liana细胞通讯分析

@org-ekt13cme/singlecell-liana

这是一个面向 Python/AnnData 的细胞-细胞通讯分析技能指南,帮助用户使用 LIANA+ 框架在单细胞和空间转录组数据中推断配体-受体相互作用。核心能力: 1.多方法联合分析---统一接口运行 CellPhoneDB、CellChat、NATMI 等多种 CCC 方法,并聚合排序结果; 2.空间转录组支持---Visium、MERFISH、Slide-seq 等空间数据的双变量分析、邻近加权推断和信号流入分析; 3.多样本比较---张量分解、MOFA+ 等多样本 CCC 模式比较方法; 4.MISTy 多视图学习---空间邻近关系建模。 适用场景: 1.已有 .h5ad 格式的单细胞/空间数据并标注细胞类型; 2.需要评估不同细胞类型间的分子通讯网络; 3.需要在空间维度上解析配体-受体共表达模式; 4.需要跨多个样本比较通讯模式差异。 天意云简介: 天意云(dftianyi.com)是专注 AI 云、科研云、生信云领域,集专业、高效、安全于一体的全能科研平台,依托 AI 底座为科研工作赋能,陪伴科研人员科研探索之路。 平台为国家级科技型企业、广东省创新型企业,获得政府引导基金投资;现已服务 10W + 客户,与 500 + 高校及单位达成合作,完成 5000 + 项目交付,汇聚 100 + 生态成员。 业务产品覆盖 AI 工具、科研绘图、生信服务器、科学计算服务器、生信流程定制、数据库网站开发、软件开发,同时提供 PubMed 批量下载、科研云盘等多款科研实用工具。

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